大豆育种研究室黑龙江省农科院重点研究室、农业部国家大豆区域技术创新中心、大豆现代产业技术体系佳木斯三江试验站、合丰号大豆原原种生产基地和哈尔滨国家大豆改良分中心建设技术依托单位，在不同历史时期为黑龙江省乃至我国大豆育种与生产做出了突出的贡献，育种水平居全国领先地位，是我国颇具影响的大豆育种单位之一。
    科室现有科技人员8名，其中研究员2名，副研究员2名，助理研究员1名，农技工人3名，有硕士2名，在读农业推广硕士2名。研究人员队伍结构合理，素质高，技术力量雄厚。
    佳木斯分院大豆育种起步于1951年，先后审定推广合丰号系列大豆新品种47个，年推广应用面积1200-2000万亩，占黑龙江省大豆种植面积的30-50%，占适宜种植区域种植面积的80%以上，累计推广应用面积4.5亿亩，创纯社会经济效益120亿元；品种推广应用范围由黑龙江省扩大到吉林、内蒙古、辽宁、河北、云南、新疆等全国十二个省（区）。合丰号大豆品种使黑龙江省大豆生产品种更新换代5-6次，亩产提高了25-50kg。先后获得了各级成果奖励50多项，其中省部级以上成果奖励11项，发表文章80多篇。这些成果水平达到了国内同类研究领先和世界同类研究的先进水平，极大地提升了大豆生产水平和推动大豆科技进步。
    “八五”以来先后承担各级研究课题50多项，国级项目12项，主持“十五”国家863计划子课题“大豆高效育种技术及优质、高产、多抗、专用新品种培育”、农业部科技跨越计划项目和重大结构调整研究专项、科技部成果转化基金项目等多项课题，始终是省科技厅大豆育种攻关项目的承担单位，主持省农业良种化工程高油大豆项目7项。
    育成了一批全国推广面积大、效益高的品种。合丰25号年最大推广应用面积1500万亩，1987-1998年连续11年年推广应用面积超1000万亩，2005年推广应用面积仍在200万亩以上，自1984-2005年累计推广应用面积1.8亿亩，纯增产大豆26.3亿kg，创纯社会经济效益39.5亿元，成为中国大豆品种推广面积最大、应用时间最长、效益最高的名牌品种，获国家科技进步三等奖和黑龙江省重大科技效益奖；合丰35号年最大种植面积850万亩，占适宜种植区域种植面积40-50%，1998、1999年年推广应用面积位居全国第一，累计推广面积6500万亩，纯增产大豆11.0亿kg，创纯社会经济效益28.4亿元，获国家科技进步二等奖和黑龙江省重大科技效益奖；合丰39号2000年由黑龙江省审定推广，累计种植面积850万亩，纯增产大豆1.8亿kg，创纯社会经济效益3.7亿元，2003年获黑龙江省政府技术发明二等奖；合丰45号2003年由黑龙江省审定推广，2006年种植面积达到672.7万亩，年推广面积位居全国第一，累计推广面积1471万亩，纯增产大豆3.8亿kg，创纯社会经济效益11.1亿元。
    在国内领先育成育成了中国第一批抗灰斑病大豆品种合丰27号、合丰28号、合丰29号和合丰30号等4个品种，相继育成合丰32号、合丰33号、合丰34号、合丰42号、合丰45号和合丰49号等6个品种，创造抗灰斑病8－10个生理小种的优秀资源4份，品种累计推广面积4500万亩，获纯社会经济效益16.2亿元，有效地解决了灰斑病对黑龙江省大豆生产的危害，成果水平达到了国内外同类研究的先进水平。“高抗灰斑病大豆新品种合丰30号的选育”1992年获黑龙江省科技进步二等奖；“双抗大豆新品种合丰33号的选育”1995年获黑龙江省农业科技进步二等奖；“大豆抗灰斑病新种质的创新及利用”1999年获黑龙江省农业科技进步二等奖；在品种选育过程中，通过理论研究明确灰斑病1号优势小种的遗传规律，建立了育种程序，为指导大豆灰斑病育提供科学依据，填补了灰斑病育种理论的空白。
    近年来育成了合丰40、41、42、、45、47、48、50、52号等8个高油大豆品种，油分含量达21.5-23.24%，其中5个品种列入黑龙江省良种化工程，并列为国家大豆振兴计划重点推广品种，合丰40、41号是全国高油品种推广应用面积最大的品种，2004、2005年分别获黑龙江省政府科技进步二等奖。合丰42号2003年获国家“十五”农作物品种二等后补助奖励，2006年获黑龙江省农业科技进步一等奖；合丰47号2005年获国家农作物品种二等后补助奖励，并列为2006、2007年农业部推荐大豆生产上主导品种。